Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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