Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC84Q86UT8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms