Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC33.82■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC33.82■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC33.8■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC33.79■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC33.79■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC33.78■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC33.77■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PBRM1Q86U86 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms