Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5S9

TMEM144, Transmembrane protein 144, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM144Q7Z5S9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMEM144Q7Z5S9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM144Q7Z5S9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM144Q7Z5S9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM144Q7Z5S9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM144Q7Z5S9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM144Q7Z5S9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM144Q7Z5S9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM144Q7Z5S9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM144Q7Z5S9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM144Q7Z5S9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM144Q7Z5S9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM144Q7Z5S9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM144Q7Z5S9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM144Q7Z5S9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM144Q7Z5S9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM144Q7Z5S9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM144Q7Z5S9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM144Q7Z5S9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM144Q7Z5S9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM144Q7Z5S9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM144Q7Z5S9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM144Q7Z5S9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM144Q7Z5S9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms