Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVN7

SEM1, Putative protein SEM1, isoform 2, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEM1Q6ZVN7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEM1Q6ZVN7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEM1Q6ZVN7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEM1Q6ZVN7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEM1Q6ZVN7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEM1Q6ZVN7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEM1Q6ZVN7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEM1Q6ZVN7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEM1Q6ZVN7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEM1Q6ZVN7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEM1Q6ZVN7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEM1Q6ZVN7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEM1Q6ZVN7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEM1Q6ZVN7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEM1Q6ZVN7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEM1Q6ZVN7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEM1Q6ZVN7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEM1Q6ZVN7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEM1Q6ZVN7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEM1Q6ZVN7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEM1Q6ZVN7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEM1Q6ZVN7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEM1Q6ZVN7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEM1Q6ZVN7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEM1Q6ZVN7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SEM1Q6ZVN7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms