Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms