Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms