Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SUSD1Q6UWL2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms