Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASC1Q6TDU7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASC1Q6TDU7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASC1Q6TDU7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASC1Q6TDU7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASC1Q6TDU7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASC1Q6TDU7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASC1Q6TDU7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASC1Q6TDU7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASC1Q6TDU7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASC1Q6TDU7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASC1Q6TDU7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASC1Q6TDU7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CASC1Q6TDU7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASC1Q6TDU7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASC1Q6TDU7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASC1Q6TDU7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASC1Q6TDU7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASC1Q6TDU7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASC1Q6TDU7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASC1Q6TDU7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASC1Q6TDU7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASC1Q6TDU7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CASC1Q6TDU7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CASC1Q6TDU7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CASC1Q6TDU7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASC1Q6TDU7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms