Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMARCD3Q6STE5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms