Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
USP17L2Q6R6M4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
USP17L2Q6R6M4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L2Q6R6M4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L2Q6R6M4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L2Q6R6M4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L2Q6R6M4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L2Q6R6M4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L2Q6R6M4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L2Q6R6M4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L2Q6R6M4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L2Q6R6M4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L2Q6R6M4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L2Q6R6M4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L2Q6R6M4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L2Q6R6M4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L2Q6R6M4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L2Q6R6M4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L2Q6R6M4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L2Q6R6M4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L2Q6R6M4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L2Q6R6M4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L2Q6R6M4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L2Q6R6M4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L2Q6R6M4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L2Q6R6M4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L2Q6R6M4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L2Q6R6M4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24■■□□□ 1.43
USP17L2Q6R6M4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L2Q6R6M4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L2Q6R6M4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L2Q6R6M4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L2Q6R6M4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L2Q6R6M4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L2Q6R6M4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L2Q6R6M4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L2Q6R6M4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L2Q6R6M4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms