Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6Q795 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6Q795 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6Q795 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6Q795 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6Q795 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6Q795 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6Q795 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6Q795 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6Q795 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6Q795 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6Q795 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6Q795 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6Q795 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6Q795 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6Q795 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6Q795 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6Q795 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6Q795 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6Q795 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6Q795 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6Q795 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6Q795 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6Q795 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6Q795 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6Q795 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6Q795 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6Q795 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6Q795 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6Q795 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6Q795 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6Q795 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6Q795 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6Q795 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6Q795 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6Q795 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6Q795 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6Q795 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6Q795 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6Q795 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6Q795 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6Q795 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Q6Q795 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Q6Q795 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6Q795 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Q6Q795 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Q6Q795 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Q6Q795 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6Q795 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6Q795 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6Q795 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6Q795 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6Q795 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6Q795 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6Q795 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6Q795 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6Q795 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6Q795 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Q6Q795 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6Q795 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6Q795 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6Q795 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6Q795 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6Q795 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6Q795 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6Q795 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6Q795 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6Q795 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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