Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms