Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms