Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms