Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCAPH2Q6IBW4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms