Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VIRMAQ69YN4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VIRMAQ69YN4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms