Protein–RNA interactions for Protein: Q69YH5

CDCA2, Cell division cycle-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA2Q69YH5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms