Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LARP1BQ659C4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms