Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ECM29Q5VYK3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms