Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRPF38BQ5VTL8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms