Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HIVEP3Q5T1R4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms