Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CEP170Q5SW79 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CEP170Q5SW79 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CEP170Q5SW79 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CEP170Q5SW79 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CEP170Q5SW79 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CEP170Q5SW79 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CEP170Q5SW79 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CEP170Q5SW79 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CEP170Q5SW79 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CEP170Q5SW79 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CEP170Q5SW79 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CEP170Q5SW79 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CEP170Q5SW79 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CEP170Q5SW79 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CEP170Q5SW79 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CEP170Q5SW79 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CEP170Q5SW79 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CEP170Q5SW79 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CEP170Q5SW79 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CEP170Q5SW79 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CEP170Q5SW79 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CEP170Q5SW79 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
CEP170Q5SW79 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
CEP170Q5SW79 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CEP170Q5SW79 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CEP170Q5SW79 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CEP170Q5SW79 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CEP170Q5SW79 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CEP170Q5SW79 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CEP170Q5SW79 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CEP170Q5SW79 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
CEP170Q5SW79 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CEP170Q5SW79 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CEP170Q5SW79 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CEP170Q5SW79 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CEP170Q5SW79 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
CEP170Q5SW79 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms