Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms