Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HABP4Q5JVS0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HABP4Q5JVS0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms