Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNT1Q5JUK3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms