Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
XKR3Q5GH77 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
XKR3Q5GH77 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms