Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODF2Q5BJF6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms