Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC178Q5BJE1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms