Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB6CQ53S08 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms