Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL12Q53G59 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms