Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS9Q3SYG4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms