Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LETM2Q2VYF4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms