Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms