Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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