Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FAM187BQ17R55 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FAM187BQ17R55 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM187BQ17R55 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM187BQ17R55 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM187BQ17R55 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM187BQ17R55 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM187BQ17R55 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM187BQ17R55 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM187BQ17R55 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM187BQ17R55 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM187BQ17R55 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM187BQ17R55 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM187BQ17R55 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM187BQ17R55 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM187BQ17R55 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM187BQ17R55 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM187BQ17R55 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM187BQ17R55 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM187BQ17R55 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM187BQ17R55 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM187BQ17R55 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM187BQ17R55 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM187BQ17R55 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM187BQ17R55 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM187BQ17R55 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM187BQ17R55 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM187BQ17R55 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM187BQ17R55 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM187BQ17R55 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM187BQ17R55 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM187BQ17R55 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM187BQ17R55 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms