Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
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PTPROQ16827 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
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PTPROQ16827 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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PTPROQ16827 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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PTPROQ16827 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
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PTPROQ16827 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
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PTPROQ16827 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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PTPROQ16827 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
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