Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CA9Q16790 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CA9Q16790 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CA9Q16790 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA9Q16790 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA9Q16790 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA9Q16790 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA9Q16790 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA9Q16790 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA9Q16790 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA9Q16790 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA9Q16790 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA9Q16790 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CA9Q16790 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CA9Q16790 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA9Q16790 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA9Q16790 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA9Q16790 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA9Q16790 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA9Q16790 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA9Q16790 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CA9Q16790 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CA9Q16790 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CA9Q16790 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CA9Q16790 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CA9Q16790 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CA9Q16790 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CA9Q16790 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CA9Q16790 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CA9Q16790 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CA9Q16790 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CA9Q16790 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CA9Q16790 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CA9Q16790 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CA9Q16790 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CA9Q16790 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CA9Q16790 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CA9Q16790 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CA9Q16790 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CA9Q16790 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CA9Q16790 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CA9Q16790 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CA9Q16790 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CA9Q16790 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CA9Q16790 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CA9Q16790 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CA9Q16790 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CA9Q16790 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CA9Q16790 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CA9Q16790 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CA9Q16790 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CA9Q16790 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CA9Q16790 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CA9Q16790 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CA9Q16790 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CA9Q16790 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CA9Q16790 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CA9Q16790 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CA9Q16790 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CA9Q16790 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CA9Q16790 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CA9Q16790 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CA9Q16790 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CA9Q16790 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CA9Q16790 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CA9Q16790 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CA9Q16790 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CA9Q16790 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CA9Q16790 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CA9Q16790 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CA9Q16790 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CA9Q16790 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CA9Q16790 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CA9Q16790 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CA9Q16790 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CA9Q16790 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CA9Q16790 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CA9Q16790 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CA9Q16790 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CA9Q16790 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CA9Q16790 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CA9Q16790 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CA9Q16790 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CA9Q16790 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CA9Q16790 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CA9Q16790 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CA9Q16790 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CA9Q16790 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CA9Q16790 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CA9Q16790 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CA9Q16790 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CA9Q16790 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CA9Q16790 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CA9Q16790 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CA9Q16790 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CA9Q16790 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CA9Q16790 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CA9Q16790 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CA9Q16790 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CA9Q16790 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms