Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
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