Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF239Q16600 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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