Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP7Q16576 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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