Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNGA3Q16281 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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