Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms