Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ITSN1Q15811 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITSN1Q15811 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
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