Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC12□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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