Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TCEA2Q15560 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCEA2Q15560 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCEA2Q15560 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCEA2Q15560 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCEA2Q15560 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCEA2Q15560 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCEA2Q15560 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCEA2Q15560 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCEA2Q15560 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCEA2Q15560 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCEA2Q15560 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCEA2Q15560 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCEA2Q15560 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TCEA2Q15560 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCEA2Q15560 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TCEA2Q15560 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TCEA2Q15560 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCEA2Q15560 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCEA2Q15560 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCEA2Q15560 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCEA2Q15560 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCEA2Q15560 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCEA2Q15560 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCEA2Q15560 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCEA2Q15560 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCEA2Q15560 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCEA2Q15560 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TCEA2Q15560 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCEA2Q15560 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCEA2Q15560 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCEA2Q15560 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCEA2Q15560 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCEA2Q15560 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TCEA2Q15560 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCEA2Q15560 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCEA2Q15560 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms