Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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