Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTF1Q15361 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
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