Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NECTIN1Q15223 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
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