Protein–RNA interactions for Protein: Q15119

PDK2, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK2Q15119 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK2Q15119 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms